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“基因魔剪”有了脫靶突變檢測(cè)系統(tǒng)

  據(jù)英國(guó)《自然》雜志12日在線發(fā)表的一項(xiàng)基因編輯學(xué)研究,歐洲與美國(guó)科學(xué)家團(tuán)隊(duì)報(bào)告稱:針對(duì)CRISPR-Cas9基因組編輯的全基因組脫靶效應(yīng)的高效檢測(cè)系統(tǒng),在小鼠身上完成了測(cè)試。該研究成果將促進(jìn)基因組編輯從研究到臨床的轉(zhuǎn)化。

  CRISPR-Cas9基因組編輯技術(shù)有“基因魔剪”之稱,被認(rèn)為是人類醫(yī)學(xué)史上具有巨大潛力的創(chuàng)新技術(shù),但只有在完全識(shí)別并消除額外的非目標(biāo)(脫靶)突變時(shí),這項(xiàng)技術(shù)才能真正實(shí)現(xiàn)臨床應(yīng)用。

  所謂脫靶突變,指的是CRISPR-Cas9復(fù)合物附著在基因組的多位點(diǎn)上,并切割了錯(cuò)誤的DNA片段。檢測(cè)這種突變的系統(tǒng)必須在體外以及整個(gè)生物體內(nèi)都進(jìn)行測(cè)試。

  此次,美國(guó)麻省總醫(yī)院以及瑞典阿斯利康公司的研究人員,描述了一種靈敏度較高的“體內(nèi)脫靶驗(yàn)證”(verification of in vivo off-targets,簡(jiǎn)稱VIVO)系統(tǒng),可以檢測(cè)CRISPR-Cas9在生物體中的脫靶突變。VIVO系統(tǒng)會(huì)事先識(shí)別出潛在的脫靶位點(diǎn),在基因組編輯后再確認(rèn)這些位點(diǎn)中是否有位點(diǎn)發(fā)生了改變。研究團(tuán)隊(duì)在小鼠肝臟中檢測(cè)了該系統(tǒng)的準(zhǔn)確度,方法是設(shè)計(jì)出靶向小鼠體內(nèi)Pcsk9基因的多種向?qū)NA(gRNA),包括混雜性(可以靶向多位點(diǎn))的gRNA和特異性更高的gRNA。

  結(jié)果證實(shí),VIVO系統(tǒng)不僅能檢測(cè)到混雜性gRNA誘導(dǎo)的數(shù)十種脫靶突變(包括發(fā)生率僅為0.13%的突變),而且正確設(shè)計(jì)的gRNA并不會(huì)帶來(lái)任何可檢測(cè)到的脫靶突變。

  研究人員認(rèn)為,VIVO系統(tǒng)為定義基因組編輯在實(shí)際應(yīng)用中的脫靶效應(yīng)設(shè)立了重要標(biāo)準(zhǔn),并證實(shí)了設(shè)計(jì)出特異性極高的gRNA的重要性。

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