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三分鐘帶你了解當前最熱的基因編輯技術

  基因編輯技術指能夠讓人類對目標基因進行“編輯”,實現(xiàn)對特定DNA片段的敲除、加入等。而CRISPR/Cas9技術自問世以來,就有著其它基因編輯技術無可比擬的優(yōu)勢,技術不斷改進后,更被認為能夠在活細胞中最有效、最便捷地“編輯”任何基因?;蚓庉嬍且环N遺傳工程技術,針對某個序列已知但功能未知的序列,通過改變生物的遺傳基因,使其特定的基因功能喪失作用,通過研究對生物體造成的影響,進而推測出該基因的生物學功能。本文為你科普基因編輯三大技術:

  基因敲除

  進行DNA水平編輯。一般用于構建基因敲除鼠模型。

  CRISPR/Cas9:CRISPR/Cas9系統(tǒng)作為細菌和古細菌的獲得性免疫系統(tǒng),通過RNA介導特異性的切割外源遺傳物質,用以對抗入侵的病毒和質粒。使用Cas9切口酶和一對sgRNA,兩個相近的切口造成DNA雙鏈斷裂,誘導細胞發(fā)生非同源末端連接修復,造成目的基因的突變。

  CRISPR/Cas9技術自問世以來,取代“鋅指核酸內切酶(ZFN)”、“類轉錄激活因子效應物核酸酶(TALEN),成為科研、醫(yī)療等領域的有效工具”.一般通過體外轉錄得到sgRNA與cas9的mRNA,通過注射到原核期受精卵內,移植到假孕母鼠體內獲得基因編輯的小鼠進行基因功能研究。

  構建方法:

  確定待敲除基因的靶位點。

  設計識別靶位點的識別的一對sgRNA。

  構建可表達sgRNA的Cas9質粒。

  體外轉錄sgRNA 和Cas9 RNA。

  將sgRNA和Cas9 RNA直接注射入受精卵檢測sgRNA活性。

  將有活性的sgRNA和Cas9 RNA直接注射入受精卵建立Founder。

  將Founder自交得到F1代。

  適用范圍:

  制備敲除鼠,利用敲除鼠進行基因功能的研究;進行細胞水平敲除基因時,可以選擇慢病毒載體,構建lenticrispr-v2質粒,通過包裝病毒進行細胞水平敲除。

  基因敲減

  RNA水平,是指通過降解具有同源序列靶基因的mRNA,達到阻止基因表達的作用。一般用于細胞水平敲減基因。

 ?。?)RNA干擾:

  是siRNA雙鏈結合一個核酶復合物從而形成所謂RNA誘導沉默復合物RISC。激活的RISC通過堿基配對定位到同源mRNA轉錄本上,并在距離siRNA3’端12個堿基的位置切割mRNA,該mRNA發(fā)生降解而導致基因表達沉默,是一種特異性的轉錄后基因沉默。

  一般合成針對靶基因的siRNA,通過轉染的方法使之進入細胞內,使靶基因沉默。這一方法受轉染效率的影響較大。目前有不少基因的siRNA已經(jīng)有商業(yè)產品,所以使用時買來就可以了,比較方便。

  適用范圍:

  一般通過公司合成后,通過轉染細胞進行細胞水平敲減。

  (2)shRNA:

  “短發(fā)夾RNA”,shRNA包括兩個短反向重復序列,中間由一莖環(huán)(loop)序列分隔的,組成發(fā)夾結構,由polⅢ啟動子控制。隨后再連上5-6個T作為RNA聚合酶Ⅲ的轉錄終止子。

  構建shRNA的病毒表達載體,常用的病毒載體有腺病毒載體、腺相關病毒載體、慢病毒載體等,機制與質粒載體相似,利用了病毒感染細胞效率比較高的特點,解決了用質粒載體轉染效率低的缺陷。

  構建方法:

  shRNA設計:設計RNA干擾序列是RNAi實驗的關鍵。

  載體構建:可根據(jù)實驗需求選擇慢病毒、腺病毒載體。

  轉染細胞:常用的方法包括磷酸鈣轉染、脂質體轉染、電穿孔轉染等

  觀測GFP 熒光和穩(wěn)定表達細胞系篩選:可用于帶有GFP標簽的質粒載體。

  檢測RNA 干擾效率:可以在蛋白水平或mRNA水平檢測RNA干擾效率。

  適用范圍:

  一般通過構建慢病毒、腺病毒等進行細胞水平敲減。

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